mNGS联合常规微生物检测可缩短ICU内SCAP的临床改善时间！詹庆元教授团队发表全球首个mNGS临床应用前瞻性随机对照研究

詹庆元，吴小静等中日友好医院发布于2024-07-30 浏览 4602 收藏

国家呼吸医学中心、中日友好医院呼吸中心詹庆元教授团队近日在CHEST发表最新研究成果，题为“Effect of Metagenomic Next-Generation Sequencing on Clinical Outcomes of Patients with Severe Community-Acquired Pneumonia in ICU: A Multicenter Randomized Controlled Trial（mNGS对ICU内重症社区获得性肺炎患者临床结局的影响：一项多中心随机对照试验）”。

该研究的重要发现：三个“首次”

首次通过前瞻性多中心随机对照试验评估了mNGS在ICU内重症社区获得性肺炎（SCAP）患者中应用的临床意义，为mNGS的临床使用提供了循证医学证据。
首次全部使用支气管肺泡灌洗液（BALF）作为SCAP患者的mNGS病原学检测标本，诊断和结果更加可靠。
首次证实了mNGS不仅能提高SCAP患者的诊断率和缩短诊断时间，还能进一步提高临床抗感染治疗的精准性，指导抗生素降阶梯应用，减少抗生素滥用。

该研究发现，与单独使用常规微生物检测方法（CMT）相比，mNGS联合CMT可以缩短ICU内SCAP患者的临床改善时间，并提高14天内临床改善率。

一、

研究方法

该研究为中国大陆地区10家三甲医院ICU进行的一项多中心、随机、非盲的临床试验。患者以1:1的比例按照分层区组随机方法分组，入选后均行气管镜获取BALF标本，接受常规微生物检测（CMT组）或CMT基础上同时接受mNGS检测（mNGS组）。

二、

研究结果

1. mNGS可提高ICU内SCAP患者的病原学诊断率，并精确指导抗感染方案的调整

研究共入组349例SCAP患者，其中mNGS组179例，CMT组170例。349例患者中207例（59.3%）患者获得明确病原学诊断。mNGS结果回报的中位时间为47h（37,50）。mNGS组和CMT组的病原学诊断率分别为79.9%（143/179）和38.8%（66/170）（P<0.001）。mNGS组更多患者抗生素获得降阶梯调整，显著高于CMT组（20.7% vs 10.6%；P=0.010）。这一优势在免疫功能正常的患者中尤为显著（20.2% vs 10.9%；P=0.042）。

2. mNGS可缩短ICU内SCAP患者临床改善时间

mNGS组患者28天内临床改善的中位时间为10天，CMT组为13天[HR=1.558（95%CI: 1.195～2.030），P<0.001]。亚组分析显示，免疫抑制患者中mNGS组和CMT组的临床改善时间存在差异趋势（P=0.057）。免疫功能正常患者中，两组28天内临床改善时间存在显著性差异[9天 vs 10天；HR=1.539（95%CI: 1.132～2.093）；P=0.005]。

3. 两组患者在死亡率方面无显著差异

mNGS组患者14天内临床改善的患者比率（62.0%）显著高于CMT组（46.5%）。两组患者在28天无机械通气时间、28天死亡率、ICU内死亡率、住院死亡率、ICU住院时间、总住院时间、ICU费用和总住院费用方面没有显著差异。

三、

主要研究结论

与单独使用常规微生物检测方法（CMT）相比，BALF标本mNGS联合CMT可以缩短ICU内SCAP患者的临床改善时间。
mNGS有助于早期准确的致病微生物诊断和抗生素管理，有利于实现ICU早期精准抗感染治疗，减少抗生素滥用。

该研究通讯作者：詹庆元(中日友好医院)

共同第一作者：吴小静、贺航咏(中日友好医院), 孙婷(滨州医学院附属医院), 邢丽华(郑州大学第一附属医院), 程真顺(武汉大学中南医院), 耿爽(武汉市中心医院), 徐德祥(青岛市中心医院), 罗红(湘雅二医院), 陈成(苏州大学第一附属医院), 蒋明彦(湘潭市中心医院), 侯鹏国(大同市第三医院)

原文献：

Wu X, Sun T, He H, et al. Effect of Metagenomic Next-Generation Sequencing on Clinical Outcomes of Patients with Severe Community-Acquired Pneumonia in ICU: A Multicenter Randomized Controlled Trial[J]. CHEST. Available online 25 July 2024.

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0012369224048633

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